A natureza multidisciplinar do grupo reflete na diversidade de linhas de pesquisas, entre as quais, se destacam:
Estudo da diversidade microbiana associada a diferentes ambientes
Bioprospecção de micro-organismos de interesse agrícola
Genômica, metagenômica e bioinformática
Bioprospecção de enzimas microbianas e projetos de biodestoxificação
Biorremediação de ambientes impactados com óleo
Mapeamento tecnológico da biotecnologia sustentável e suas áreas com potencial inovador.